실험장비 이야기/유전자증폭

[ In-Situ PCR ] Multi-Purpose Mudule 이란? In-situ PCR 전용 블럭, Thermal Cycler A300

(주)바이오앤드 2018. 4. 19. 11:37

안녕하세요?


바이오앤드 입니다.


이번 시간에는 PCR 과정에서 in situ PCR 에 대하여 알아 보겠습니다.


먼저 in situ 의 뜻을 알아야 하는데요, in situ 는 (현지내)를 뜻하는데, ex situ 라고 하면 (현재외) 를 지칭합니다. 일반적으로 생물학적 측면에서 생태복원연구시에 많이 사용되는 문구로

' in situ '는 one pot reaction" 이라고 표현하기도 합니다.

즉, " 한 용기내에서 반응" 이란 뜻입니다.


결국 in situ 는 실험기기가 같은 자리를 반복해서 움직이며 측정을 하고 한 샘플 위에서 같은 면을 관찰 할 때 쓰이는 용어입니다.


참고로, in vitro 와 in vivo는 생물학에서 기내실험 혹은 체내실험이냐 하는 말을 뜻합니다.


그러면, in situ 에 관련하여 유전적인 발현여부에 대하여 여러가지 복잡한 과정이 필요한데요,


가령, in situ hybridization (ISH),  chemogenic in situ hybridization (CISH), fluorescence in situ hybridization (FISH) 등등 다양한 과정의 Hybridization 이 필요합니다.

이는 특정한 위치의 target nucleic acid (표적핵산) 에 tissue (조직) 나 cell (세포)를 붙이기 위한 과정으로 화학적방법으로 붙이는지, 형광물질로 붙이는지에 따라서 그 과정이 달라지는 것입니다.


결국 ' Blot Hybridization ' 을 통하여 nucleic acid probe 를 합성시키거나 labeled (표시인자 붙이기) , purified (정제), annealed (풀리게하기) 의 과정을 하기 위해서 여러단계의 실험 중에

PCR (다중연쇄반응) 이 필요한데요,

일반 PCR과는 달리 in situ hybridization (ISH) 의 PCR 을 일반적으로 "in situ PCR" 이라고 합니다.


따라서, Cell 이나 Tissue 에 ISH 를 수행하기 위해서 일반적으로 Slide 위에 Cell 이나 Tissue 를 올리고 여러과정에 맞는 blot hybridation 을 실시하게 됩니다.

아래의 사진을 참조하세요.






이렇게 Cell 이나 Tussue 를 사용하다 보니 Slide를 사용하게 되는데요, 일반 튜브용기로 손쉽게 사용하던 PCR과는 달리 전용 in situ PCR 블럭 혹은 모듈이 필요하게 됩니다.





저희 바이오앤드에서는 여러가지의 다양한 Themal Cycler PCR제품을 판매하고 있는데, 그 중에서 앞에 설명드린 in situ PCR 을 할 수 있도록 최적화되어 있는 in situ PCR 모듈을 제공하고 있습니다.


현재 판매하고 있는 Thermal Cycler PCR 중에서 ArtGene 시리즈 A100 / A200 / A300 입니다.




          < A100 일반형 / A200 그레디언트형 >                                              < A300 그레디언트형 >


주로 많이 사용하시는 96wells 모듈을 기본적으로 탑재가 되어 있습니다.


여기기 in situ PCR 을 하기 위해서 필요한 전용 Multi Purpose Module 을 96wells 위에 올리고

사용을 하시면 됩니다.




위에 보시는 블럭모듈은 96wells 기본 모듈블럭입니다.





기본에 튜브를 담을 수 있는 96wells Cloumn 은 덥도록 제작이 되어 블럭에 밀착하여 최고의 온도 조건을 유지하도록 설계가 되어 있습니다.





일반 96well 블럭에 덮습니다.





in situ PCR 전용블럭을 덮은 후 보이는 총 4칸에 Slide를 놓고 원하는 온도와 시간별로 세팅을 하여 in situ PCR 을 진행하시면 됩니다.



참고로 in situ PCR을 하기 위해서는 전용블럭과 Themal Cycler PCR 기기가 필요한데요,

저희 회사에서 판매하는 PCR 은 아래와 같습니다.






이상 이번 시간에는 in situ PCR 에 대하여 알아보았습니다.

보다 자세한 제품에 대하여 알고 싶다면 아래의 연락처로 문의 부탁드리겠습니다.





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