실험장비 이야기/유전자증폭

PCR (Thermal Cycler)의 Ramping Rate란??

(주)바이오앤드 2014. 4. 1. 10:29

Ramping Rate ??

 

 

PCR machine (Thremal Cycler)를 확인 하실때, 제품의 Spec에 대해서 보시다 보면 ramping rate (heating rate / cooling rate)에 대한 설명이 나옵니다.

 

 

 

예)

 

위에 보시는 것처럼 대부분 heating rate / cooling rate를 표기합니다. 바로, 이 heating / cooling rate가 바로 ramping rate라고 합니다. 이 spec이 바로 PCR에서 가장 중요한 부분이라고 할 수 있습니다.

 

PCR의 가장 중요한 기능이 PCR에 필요한 시약 (Mixture)를 넣고 여기에 들어간  DNA를 double strand 에서 single strand로 풀어주는 과정을 반복하는 것인데 이를 제어하는 것을 온도로 제어를 합니다.

 

 

 

 

 

PCR의 과정 예)

 

Pre Denaturation : 94℃ 5min

 

PCR : OO Cycle

 

Denaturation : 94℃ 30s

고온으로 DNA가 double strand에서 single strand로 풀리게 하는 과정

 

Annealing    : 55℃ 30s

온도를 낮추어 single strand로 풀린 DNA와 primer가 붙게 하는 과정

 

Extension    : 72℃ 30s

DNA polymerase가 활동하기 가장 좋은 온도 조건으로 single strand에 붙은 primer부터 DNA가 double strand로 합성이 되는 과정

 

Final Extension : 72℃ 5min

 

 

 

 

 

PCR은 위의 Cycle 과정을 통해 증폭이 이루어 지게 됩니다. Ramping rate는 바로 cycle을 하는데 온도가 변하는 속도를 말하는 것으로 ramping rate가 느리면 느릴수록 PCR과정에 소요되는 시간이 오래 걸린다고 보시면 됩니다.

 

반대로 얘기하면 ramping rate가 빠르면 빠를수록 실험이 더 빨리 끝날수 있습니다.

 

 

 

저희가 취급하고 있는 LongGene사의 PCR의 변천을 보았을 경우의 예를 들어 보겠습니다.

 

 

 

LongGene PCR Machine의 History

 

2001년 MG25+ 제작  (Heating Rage : 3℃ / Cooling Rate : 2℃)

 

2003년 MG Series 제작 (Heating Rage : 3℃ / Cooling Rate : 2℃)

 

2008년 MGL Series 제작 (Heating Rage : 4℃ / Cooling Rate : 3℃)

 

2010년 ArtGene Series 제작 (Heating Rage : 4℃ / Cooling Rate : 3.5℃)

            MGL Series 업그레이드 (Heating Rage : 4℃ / Cooling Rate : 3.5℃)

 

2011년 ArtGene A300 Series 제작 (Heating Rage : 6℃ / Cooling Rate : 6℃)

            ArtGene Series 업그레이드 (Heating Rage : 5℃ / Cooling Rate : 4℃)

 

 

 

현재 사용하고 있는 peltier-based PCR machine의 보급이 1999년 시작된 이래 ramping rate를 올리는 이유는 바로 실험에 이용되는 시간을 최대한으로 절약을 할뿐만아니라 PCR의 과정이 길어지면 artifact가 생성될 위험이 높아지기 때문에 현재 개발되어 새롭게 출시되는 PCR machine의 경우에는 대부분 ramping rate가 높은 제품이 대부분입니다.

 

 

현재 저희가 취급하고 있는 LongGene instrument 사의 경우에는 현재 보급되고 있는 peltier-based PCR (Thermal Cycler)가 최초 보급된 1999년 이후 2001년 부터 Thermal Cycler를 제작하는 오랜 역사를 지닌 회사로서 뛰어난 내구성과 실험자에게 더 편리하게 사용이 되기위한 제품을 개발하고 있으며, 과거 유명 브랜드 였던 MJ Research 사에 OEM 제작이후 단독 브랜드로 LongGene 브랜드로 출시 이후 세계각국에서 많은 관심을 받는 브랜드로 알려져 있습니다.

 

 

 

PCR Machine을 고려중이신가요??

 

그렇다면 오랜 역사를 지닌 LongGene 제품도 한번 고려해 보시면 어떨까요?